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Les ganglions sont situés aux ouvertures des voies lymphatiques et forment un réseau complexe qui draine la peau ainsi que les organes internes. Comme la rate, les ganglions possèdent une capsule de fibres de collagène Les ganglions normaux ont une taille de 1 a 15 mm et sont de forme ronde ou en forme de haricot. Les voies lymphatiques afférentes pénètrent dans la capsule, passent ensuite sous la capsule sous forme de sinus marginaux et se dirigent finalement en tant que sinus inter-folliculaire s vers le centre du ganglion pour y confluer et former le sinus de la moelle. La lymphe quitte le ganglion par un seul vaisseau lymphatique efferent qui longe les vaisseaux sanguins.

La zone marginale ou cortex superficiel du ganglion contient avant tout des lymphocytes B, tandis que les lymphocytes T se trouvent dans la zone paracorticale (ou cortex profond) sousjacente. Suite à une stimulation antigémque, les amas spongieux de cellules B (follicules primaires) se transforment en follicules secondaires dans lesquels un centre germinatif d'éléments blastoides (centrocytes et centroblastes) et un manteau de petits lymphocytes peuvent être distingués.